数据集概述
本数据集来自三刺鱼（Gasterosteus aculeatus）多种群免疫与生活史关联的遗传研究，包含2015年Uist地区采样的实验数据。通过qPCR量化免疫基因表达、RAD-seq分析基因组变异，探究野生种群免疫变异与生活史策略的进化关系。数据集含7个文件，涵盖采样信息、基因位点、SNP数据、结构分析及统计结果等内容。
文件详解
- Uist 2015 Life History Bayenv Locus Info.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含基因座（LOCUS）、染色体（CHR）、碱基位置（BP）等遗传位点信息，记录三刺鱼基因组中与免疫和生活史关联的基因座位置数据。
- Uist 2015 Life History Sampling Main Data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含三刺鱼种群采样的核心信息，可能涉及种群类型（短寿命、长寿命、溯河型）、样本编号、采集地点等基础元数据。
- Uist 2015 Life History Bayenv SNPfile.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：单核苷酸多态性（SNP）数据文件，用于Bayenv分析，记录种群间的遗传变异位点信息。
- Uist 2015 Life History FastSTRUCTURE.bed
- 文件格式：BED
- 字段映射介绍：FastSTRUCTURE分析所需的基因型数据文件，用于种群遗传结构解析。
- Uist 2015 Life History qPCR PCA PLINK.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，包含qPCR免疫基因表达数据的主成分分析（PCA）结果及PLINK格式的统计分析文件，用于免疫表型与基因型的关联分析。
- Uist 2015 Life History Arlequin.arp
- 文件格式：ARP
- 字段映射介绍：Arlequin软件输入文件，用于种群遗传多样性、分化程度等统计分析。
- Uist 2015 Life History Bayenv Loci.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：Bayenv分析用的基因座列表文件，记录用于环境关联分析的基因组位点信息。
数据来源
论文“A genetics-based approach confirms immune associations with life history across multiple populations of an aquatic vertebrate (Gasterosteus aculeatus)”
适用场景
- 进化生物学研究: 分析三刺鱼不同种群免疫变异与生活史策略的遗传关联及进化机制。
- 种群遗传学分析: 利用SNP数据和结构分析文件，探究三刺鱼种群的遗传分化与结构特征。
- 免疫生态学研究: 通过qPCR数据量化免疫基因表达，结合生活史参数研究野生种群免疫适应策略。
- 环境关联分析: 利用Bayenv相关文件，解析免疫基因变异与环境因素的关联模式。
- 生物医学模型参考: 以三刺鱼为脊椎动物模型，为医学领域免疫与寿命/繁殖策略关联研究提供基础数据支持。
