ulrb算法在R中的架构与实现原始数据集

数据集概述

本数据集提供了《ulrb算法在R中的架构与实现》研究论文所用的原始数据,包含北极海洋海水样本的微生物丰度表,通过V4V5 16S rRNA基因扩增子测序获得,支持相关微生物群落分析。

文件详解

该数据集包含三个CSV格式的微生物丰度数据文件,具体说明如下: - nice_ASVs.csv: CSV格式,长格式的ASV(扩增子序列变体)丰度表。 - nice_otu_long.csv: CSV格式,长格式的OTU(操作分类单元)丰度表,包含OTU、分类层级(域、门、纲等)、样本ID及丰度字段。 - nice_otu_wide.csv: CSV格式,宽格式的OTU丰度表,行代表样本ID,列代表OTU,单元格值为丰度。

适用场景

  • 微生物生态学研究: 分析北极海洋微生物群落的组成与结构。
  • 生物信息学方法验证: 用于测试或复现ulrb算法对微生物稀有种的识别效果。
  • 测序数据分析: 探究16S rRNA基因扩增子测序数据的不同格式(长/宽表)对下游分析的影响。
  • 极地海洋环境研究: 辅助研究北极海冰区域微生物群落与环境因子的关联。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.24 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。