数据集概述
本数据集为真核生物早期分化研究的基因组数据,包含四类中心异养生物(Centrohelida)的高质量转录组序列及相关处理文件,旨在通过系统发育分析解决真核生物进化树中的争议节点,填补关键类群基因组数据空缺,支持对Centrohelida、Haptophyta和Cryptista进化起源的研究。
文件详解
- 转录组序列文件
- 文件名称:Acanthocystis_sp_transcriptome.fasta.zip、Choanocystis_sp_transcriptome.fasta.zip、Raineriophrys_erinaceoides_transcriptome.fasta.zip、Amastigomonas_sp_transcriptome.fasta.zip、Raphidiophrys_heterophryoidea_transcriptome.fasta.zip
- 文件格式:ZIP压缩包(内含FASTA文件)
- 字段映射介绍:包含不同中心异养生物类群的转录组序列数据
- 序列处理文件
- 文件名称:fasta_untrimmed.zip、fasta_trimmed.zip
- 文件格式:ZIP压缩包(内含FASTA文件)
- 字段映射介绍:分别包含未修剪和已修剪的序列数据
- 系统发育树文件
- 文件名称:trees.zip
- 文件格式:ZIP压缩包
- 字段映射介绍:包含系统发育分析生成的进化树数据
适用场景
- 真核生物系统发育研究: 用于构建真核生物进化树,分析早期分化节点及类群间的亲缘关系
- 中心异养生物进化分析: 研究Centrohelida、Haptophyta和Cryptista的进化起源与分类地位
- 基因组数据填补研究: 为缺失基因组数据的关键真核生物类群提供参考数据
- 质体进化关联分析: 结合进化树拓扑结构探讨质体进化的相关机制与演化路径