数据集概述
本数据集包含加州植物区系省（CFP）森林蝎子Uroctonus的基因组数据及分析文件，通过ddRADseq技术获取遗传结构信息，并结合物种分布模型（SDMs）分析现生及末次盛冰期栖息地。数据揭示该物种存在两大遗传类群及多个微特有种群，反映CFP生物多样性形成的历史驱动因素，共含14个文件。
文件详解
- 说明文档（.docx格式）
- 文件名称：README_for_NORTHscorp50.docx、README_for_SOUTHscorp50.docx、README_for_NORTHscorp50_snapp.docx、README_for_SOUTHscorp50_snapp.docx、README_for_UroctonusCOI.docx、README_for_ALLscorp50_snapp.docx、README_for_UroctonusRADloci.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：共7个说明文档，分别对应不同子集数据（北方种群、南方种群、COI基因、RAD位点等）的分析说明
- 序列数据文件
- 文件名称：UroctonusCOI.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：NEXUS格式DNA序列数据，含80个分类单元（ntax=80）、805个特征位点（nchar=805），记录CT基因序列信息
- 系统发育分析文件
- 文件名称：UroctonusRADloci.nex、NORTHscorp50_snapp.nex、ALLscorp50_snapp.nex、SOUTHscorp50_snapp.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：共4个系统发育分析输入文件，包含RAD位点及不同种群（北方、南方、全部）的SNAPP分析数据
- 种群结构文件
- 文件名称：NORTHscorp50.str、SOUTHscorp50.str
- 文件格式：STR
- 字段映射介绍：共2个种群结构分析文件，分别对应北方和南方蝎子种群的遗传结构数据
数据来源
论文“Genomic data reveal ancient microendemism in forest scorpions across the California Floristic Province”
适用场景
- 生物多样性热点研究：分析加州植物区系省森林蝎子的微特有性模式及形成机制
- 种群遗传学分析：利用基因组数据研究Uroctonus的遗传结构、分化时间及迁移率
- 物种分布模型验证：结合SDMs结果探讨末次盛冰期以来栖息地稳定性对物种分化的影响
- 进化驱动因素探究：研究 tectonic活动、山脉抬升、河流形成等地理事件对生物分化的作用
- 低扩散物种进化研究：以森林蝎子为模型揭示小尺度生物多样性形成的过程与规律
