数据集概述
本数据集包含东南亚Varanus属巨蜥的多基因系统发育与物种边界分析相关数据，基于5基因数据集构建系统发育树，结合贝叶斯谱系凝聚法等方法推断物种边界，揭示隐存进化关系与未记录物种多样性，用于支持生物多样性研究与保护决策。
文件详解
- 多基因序列文件
- 文件名称：mt.fasta、prlr.fasta、glor44.fasta、glor52.fasta、glor74.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含线粒体及核基因序列数据，用于构建系统发育树与物种边界分析
- 系统发育分析文件
- 文件名称：Varanus_all_concatenated.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：所有基因序列的串联数据集，用于多基因系统发育分析
- 贝叶斯分析参数文件
- 文件名称：mainparams.txt、varanus_1.bpp.ctl、INFILE
- 文件格式：TXT/CTL
- 字段映射介绍：贝叶斯物种边界分析的参数配置文件，包含分析模型与计算参数设置
- 系统发育树模型文件
- 文件名称：varanus_sptree_1q_2rr_1ucldclock0.05.xml等6个XML文件
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：不同分子钟模型（宽松分子钟、严格分子钟）下的系统发育树构建模型文件
- 样本映射文件
- 文件名称：varanus1.Imap.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：样本编号与物种/种群的对应关系映射表
- 基因分区文件
- 文件名称：Varanus_partitions
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：多基因序列分析中的基因分区定义文件
数据来源
论文“Multilocus phylogeny and Bayesian estimates of species boundaries reveal hidden evolutionary relationships and cryptic diversity in Southeast Asian monitor lizards”
适用场景
- 物种多样性进化分析: 利用多基因序列数据与物种边界推断结果，研究东南亚巨蜥的隐存物种多样性与进化关系
- 生物地理学研究: 结合系统发育树与地理分布信息，分析岛屿与大陆谱系的演化关系
- 保护生物学应用: 基于物种边界分析结果，识别优先保护的进化显著单元
- 分子系统学方法验证: 比较不同分子钟模型与物种界定方法在蜥蜴类群中的应用效果
- 分类学研究参考: 为Varanus属巨蜥的分类修订提供遗传学证据支持
