数据集概述
本数据集为论文“A salivary chitinase of Varroa destructor influences host immunity and mite's survival”的原始支撑数据,包含Varroa destructor唾液几丁质酶基因表达、RNAi沉默后的螨虫生存情况,以及对蜜蜂宿主免疫基因表达影响的实验数据,覆盖6个相关文件。
文件详解
- 文件名称:Fig2A_qPCR-salivary-glands expression-ddCt_08-10-20.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Varroa destructor唾液腺3个候选宿主调控因子的相对表达数据,以3-4个生物学重复的平均折叠变化呈现,涉及唾液腺(SG)与去除唾液腺的虫体(Whole Body – SG)样本
- 文件名称:Fig4A_qPCR-gene_silencing_08-10-20.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含RNAi介导Vd-CHIsal基因沉默后的相对表达数据,以2-67个生物学重复的平均折叠变化呈现,涉及0.9% NaCl对照组与dsRNA处理组
- 文件名称:Fig4B - survival data_08-10-20.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Varroa destructor经不同dsRNA处理后的Kaplan-Meier生存曲线数据,涉及0.9% NaCl、GFP dsRNA及Vd-CHIsal dsRNA处理组
- 文件名称:Fig5A_FPKM_DEGs_SD_12-10-20.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含蜜蜂蛹受Varroa destructor侵染后13个差异表达基因的FPKM值,涉及非寄生对照组(NP)、盐水处理螨虫侵染组(WS)及dsRNA处理螨虫侵染组(KD)
- 文件名称:Fig5B_qPCR-honey-bee_immune_genes_08-10-20.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含蜜蜂蛹免疫相关基因的qRT-PCR相对表达数据,以7-10个样本的平均折叠变化呈现,涉及不同侵染处理组
- 文件名称:S1_File.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Varroa destructor预测分泌组的Trinotate注释表格,涉及GenBank登录号、BLASTp比对结果、信号肽预测、跨膜结构域预测及基因本体注释等字段
数据来源
论文“A salivary chitinase of Varroa destructor influences host immunity and mite's survival”
适用场景
- 寄生虫分子生物学研究: 分析Varroa destructor唾液几丁质酶基因的组织表达特征
- RNAi功能验证: 研究Vd-CHIsal基因沉默对Varroa destructor生存的影响
- 宿主-寄生虫互作分析: 探究Varroa destructor唾液几丁质酶对蜜蜂宿主免疫基因表达的调控作用
- 昆虫免疫机制研究: 分析蜜蜂蛹受寄生虫侵染后的免疫基因差异表达模式