数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)VC223品系(tom-1(ok285)I基因突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包括视频跟踪数据、特征提取结果等,可用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件(Features file)
- 文件名称:tom-1 (ok1285)I on food L_2010_08_03__11_55_3546_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取数据,基于tierpsy软件分析结果,具体字段未详细说明。
- 行为数据归档文件(Behavior data archive)
- 文件名称:tom-1 (ok1285)I on food L_2010_08_03__11_55_3546.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:线虫行为数据的归档文件,wcon格式通常记录线虫运动轨迹、姿态等时间序列数据。
- 核心数据文件(Core data file)
- 文件名称:tom-1 (ok1285)I on food L_2010_08_03__11_55_3546.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,可能涉及视频帧、骨架分割信息等原始或处理后的数据,具体字段未详细说明。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析tom-1基因(ok285突变)对线虫行为模式的影响。
- 生物行为特征分析:基于视频跟踪数据研究线虫的运动、觅食等行为特征。
- 模式生物实验方法验证:参考实验方案(如E. Yemini等人的方法)优化线虫行为实验设计。
- 行为数据分析工具评估:利用数据集测试tierpsy等线虫行为分析软件的性能。