数据集概述
本数据集为新西兰高山植物辐射生物多样性研究的配套数据,聚焦Veronica属Hebe组植物。包含系统发育分析所需的基因序列比对文件、时间校准的系统发育树文件及分析参数设置文件,用于量化高山生境的原地分支发生与低海拔 colonization贡献,探究生态位适应与分化在物种多样性积累中的作用。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 内容说明:数据集说明文档,介绍文件用途及关联研究背景。
- sortadate50_alignments.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含50个基因的修剪后序列比对文件,用于构建系统发育树。
- sortadate50_trees.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含StarBEAST2分析后验分布中随机选取的2000棵树,以及TreeAnnotater生成的最大分支可信度树。
- Beauti_infile.xml
- 文件格式:XML
- 内容说明:StarBEAST2分析的参数设置文件,记录系统发育分析的校准与模型参数。
数据来源
论文“Multiple origins of mountain biodiversity in New Zealand's largest plant radiation”
适用场景
- 植物系统演化研究:利用基因比对文件和系统发育树,重建Veronica属Hebe组的演化历史与时间校准框架。
- 高山生物多样性形成机制分析:量化原地分支发生与低海拔colonization对高山物种多样性的贡献。
- 生态位分化研究:结合系统发育数据与生态位模型,探究物种气候生态位的分化模式及时空动态。
- 生物地理学分析:基于系统发育树与生物地理模型,解析新西兰南阿尔卑斯山脉植物的分布格局形成过程。
- 气候变化下高山物种适应性预测:通过生态位饱和与竞争分析,评估高山特有种面对气候变暖的生存风险。