数据集概述
本数据集包含转录组原始计数数据及配套元数据，用于复现Hussein等人关于极小超顺磁性氧化铁颗粒（VSOP）对人类单核细胞表型和功能影响的研究分析。数据集共3个文件，涵盖全血和单核细胞的转录组原始数据及实验元数据。
文件详解
- 文件名称：
metadata_wholeblood.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含全血样本的实验元数据，可能涵盖样本编号、处理条件、分组信息等实验背景数据。
- 文件名称：
raw_counts_wholeblood.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含全血样本的转录组原始计数数据，字段包括
gene_id（基因ID）、gene_name（基因名称）及多个全血样本（如A4123_RNA_01至A4123_RNA_12）的基因表达计数。
- 文件名称：
raw_counts_monocytes.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含单核细胞样本的转录组原始计数数据，字段包括基因转录本ID（如ENST00000456328.2）及对照组（Control_R1至Control_R3）、VSOP处理组（VSOP_R1至VSOP_R3）的基因表达计数。
数据来源
论文“Hussein et al. Phenotype and function of human monocytes remain mainly unaffected by very small superparamagnetic iron oxide particles. Front Nanotechnol. 2025”
适用场景
- 纳米材料生物安全性评估: 分析VSOP颗粒对人类单核细胞基因表达的影响，评估其生物安全性。
- 免疫细胞功能研究: 研究VSOP颗粒对单核细胞表型及功能相关基因的表达调控机制。
- 转录组数据分析方法验证: 用于复现转录组原始数据的标准化处理及差异表达分析流程。
- 纳米技术医学应用研究: 为VSOP颗粒在医学成像、药物递送等领域的应用提供安全性数据支持。
