数据集概述
本数据集围绕废水污染对河床不同微环境生物膜的影响展开,分析原始与处理后城市废水排放对岩生(epilithic)和砂生(epipsammic)生物膜中细菌群落组成、12种抗生素抗性基因(ARGs)及1类整合子整合酶基因(intI1)丰度,以及废水相关细菌(含潜在病原体)与ARGs的关联,揭示废水污染对河床抗性组的作用机制。
文件详解
- 文件名称:
qPCR data Subirats et al _ Mol Ecol.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含qPCR检测数据,涉及12种靶向ARGs(覆盖β-内酰胺类、氟喹诺酮类、磺胺类、四环素类、大环内酯类、万古霉素类抗性)及intI1基因的丰度数据,可能关联细菌分类单元(OTUs)相对丰度、采样位点类型(对照/受影响)、生物膜类型(岩生/砂生)等分组信息。
数据来源
论文“Wastewater pollution differently affects the antibiotic resistance gene pool and biofilm bacterial communities across streambed compartments”
适用场景
- 水体抗生素污染效应评估:分析原始/处理废水对河床生物膜抗性基因库与细菌群落的差异化影响。
- 抗性基因环境传播研究:探究废水相关潜在病原体与ARGs(如intI1、sul1、sul2、ermB)的关联机制。
- 生物膜微环境敏感性分析:比较岩生/砂生生物膜对废水污染的响应差异,筛选水体污染生物传感器。
- 环境抗性组调控研究:解析废水排放对河流抗性基因增殖与维持的驱动作用。