数据集概述
本数据集来自奇努克鲑鱼人工繁殖基因流管理有效性研究,通过全基因组方法调查了两个人工饲养品系(整合系和隔离系)三代的基因多样性,对比分析了不同管理策略对基因分化的影响,包含基因序列SNP信息和Genepop格式的基因分型数据,共2个文件。
文件详解
- Sequence_SNP_information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含奇努克鲑鱼基因序列的SNP信息,具体字段未明确说明,推测涵盖基因位点、等位基因频率、基因型分布等与单核苷酸多态性相关的数据。
- Waters_et_al_2015_Genepop.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:Genepop格式的基因分型数据,包含413个个体在9410个基因位点的基因型信息,涉及的基因位点如Ot000003_IOts12、Ot0000等,可用于群体遗传学分析。
数据来源
论文“Effectiveness of managed gene flow in reducing genetic divergence associated with captive breeding”
适用场景
- 濒危物种保护策略研究:分析人工繁殖中基因流管理对减少基因分化的效果,优化濒危物种保护方案。
- 群体遗传学分析:利用Genepop数据研究奇努克鲑鱼人工饲养群体的基因多样性、遗传结构及分化程度。
- 人工繁殖基因风险评估:评估不同人工繁殖策略(如整合系与隔离系)对种群基因适应性的影响。
- 分子生态学研究:通过SNP信息探究奇努克鲑鱼基因变异与环境适应的关系,为物种恢复提供分子依据。