维得利珠单抗治疗CD患者的PBMC单细胞RNA测序与CD14_单核细胞_bulk_RNA测序处理计数数据集

数据集概述

该数据集包含维得利珠单抗治疗的CD患者相关RNA测序处理数据,涵盖PBMC单细胞RNA测序和CD14+单核细胞bulk RNA测序的处理计数,以及样本和细胞元数据,为研究治疗响应机制提供数据支持。

文件详解

  • bulkrnaseq.zip: 压缩文件,包含CD14+单核细胞的bulk RNA测序处理计数数据
  • scrnaseq.zip: 压缩文件,包含PBMC的单细胞RNA测序处理数据
  • mtx: Cellranger生成的计数、基因和细胞数据
  • cell_metadata.csv: 细胞元数据文件,含RunID、SampleID、性别、年龄、吸烟状态、维得利珠单抗响应、多级别注释(manual_l1至manual_l4)、无监督聚类(seurat_clusters)
  • counts.csv: CSV文件,经STAR、SAMtools、Subread::featureCounts处理的计数数据,用Ensembl基因ID注释
  • metadata.csv: CSV文件,样本元数据文件,含性别、年龄、吸烟状态、维得利珠单抗响应信息

适用场景

  • 炎症性肠病治疗机制研究:分析维得利珠单抗对CD患者免疫细胞转录组的影响
  • 药物响应生物标志物探索:挖掘与维得利珠单抗治疗响应相关的基因表达特征
  • 免疫细胞亚群功能分析:研究PBMC不同细胞亚群在治疗中的转录组变化
  • 单细胞与bulk转录组整合分析:对比PBMC单细胞数据与CD14+单核细胞bulk数据的表达差异
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 145.13 MiB
最后更新 2025年12月24日
创建于 2025年12月24日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。