数据集概述
本数据集是通过SeqLengthPlot工具对伪黑珊瑚(Savalia savaglia)从头双端转录组组装结果进行序列长度评估的输出文件集合,包含转录组序列的长度分布统计数据、分类序列文件及可视化图表,共七个文件。
文件详解
数据集包含一个目录及其下的七个文件,具体说明如下:
- 目录: seq_length_Assembly_Ss_PE.Trinity/
- seq_above199bp.fasta: FASTA格式文件,包含长度为二百碱基对及以上的转录组序列
- seq_below200bp.fasta: FASTA格式文件,包含长度低于二百碱基对的转录组序列
- seq_length_distribution_above99bp.png: PNG格式图片,展示长度为二百碱基对及以上转录组序列的线性尺度长度分布直方图
- seq_length_distribution_above199_log.png: PNG格式图片,展示长度为二百碱基对及以上转录组序列的对数尺度长度分布直方图
- seq_length_distribution_below200bp.png: PNG格式图片,展示长度低于二百碱基对转录组序列的线性尺度长度分布直方图
- seq_length_distribution_below200_log.png: PNG格式图片,展示长度低于二百碱基对转录组序列的对数尺度长度分布直方图
- seq_length_stats_by_threshold_200.txt: TXT格式文件,包含转录组序列长度的详细统计数据,包括总序列数、二百碱基对及以上序列数、低于二百碱基对序列数,以及对应序列的最小和最大长度
适用场景
- 分子生物学研究: 分析伪黑珊瑚转录组序列的长度分布特征
- 基因组学分析: 评估从头转录组组装结果的质量
- 生物信息学可视化: 参考转录组序列长度分布的图表展示方式
- 转录组数据预处理: 基于长度阈值筛选有效转录组序列