维基百科分子性质数据集
数据来源:互联网公开数据
标签:化学分子,性质数据,药物发现,结构-性质关系,化学相似性
数据概述:
维基百科分子性质数据集是一个包含各种化学物质分子性质的广泛集合,这些数据来源于维基百科文章。数据集提供了有关这些分子化学结构和特征的宝贵信息,包括其疏水性、大小、重量和连接性等。每个条目代表一个独特的分子,并包含多个关键特征,这些特征涵盖了分子化学结构和性质的各种方面。例如,分子量特征表示通过加总所有原子质量得到的分子质量;最长链特征指分子中由原子形成的最长链的长度。此外,该数据集还包含其他信息属性,如曼霍尔德LogP,它代表一种反映化合物疏水性或亲水性的对数度量。还包括如拓扑极性表面积这样的描述符,用于量化化合物中可以参与极性相互作用的表面积。其他属性提供了分子内键合模式的见解,例如芳香键计数表示结构中具有芳香特征的键的数量,而最长π链则表示由π键形成的链的长度。此外,数据集中还包含各种数值度量,用于评估分子的不同方面,如复杂性(片段复杂度)或原子连接性(顶点邻接信息量)。关于氢键受体和供体的信息进一步揭示了分子间相互作用的潜在位点。该丰富数据集还包括每个分子中不同元素的计数及其各自的原子极化率和键极化率,这些是描述原子和键水平上极化行为的关键指标。数据集还提供了适应药物相似性评估的特定分子性质描述符/常数,如Lipinski五条规则,并提供了表征特定原子上过剩正电荷或负电荷的正式电荷度量。该数据集还包括分子名称和分子式等标识符,便于参考和识别。总体而言,维基百科分子性质数据集为药物和材料科学等研究领域的众多化学物质提供了全面的信息,是一个极其宝贵的资源。
数据用途概述:
该数据集适用于药物发现、结构-性质关系分析、化学相似性聚类等多种应用场景。研究人员可以利用此数据集分析分子的性质,识别潜在的药物候选物,评估药物相似性,并进行结构-活性关系的研究。此外,数据集还适用于机器学习和统计建模任务,以预测基于分子特征的特定性质或结果。该数据集也为化学相似性分析提供了基础,通过比较分子公式或结构,可以将相似的化合物聚类在一起,从而识别化学物质的家族特征或特定化学类别的结构特征。
举例说明:
该数据集包含多个描述分子性质的列,例如“分子”表示分子的化学结构,“曼霍尔德LogP”表示对数分区系数,用于测量分子的疏水性,“分子量”表示通过加总所有原子质量得到的分子质量,“原子极化率”表示分子中原子的极化能力,“拓扑极性表面积”表示分子的极性表面积,“最长π链”表示分子中由π键形成的最长链的长度,“氢键受体”表示分子中氢键受体位点的数量,“氢键供体”表示分子中氢键供体位点的数量,“分子式”表示分子的化学公式等。通过这些特征,研究人员可以进行数据探索、识别模式和趋势、统计分析、可视化以及特征工程等操作,从而更好地理解分子的性质并进行预测建模。例如,研究人员可以使用该数据集来识别满足Lipinski五条规则的潜在药物候选物,以评估其药物相似性,并分析化学结构与物理性质之间的关系。