微生物_GraftM_塑料降解酶及HMM模型数据

数据集概述

本数据集围绕全球生态系统中微生物谱系的塑料生物降解潜力展开,包含种子酶及隐马尔可夫模型(HMMs)相关信息、种子酶氨基酸序列,以及GraftM生成的HMM包,为研究塑料降解微生物及酶的分布和功能提供基础数据。

文件详解

  • 1_Enzymes and HMMs summary.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含种子酶和HMMs的信息表格,记录种子酶及对应HMM模型的相关数据。
  • 2_Seed_enzymes.faa
  • 文件格式:FAA
  • 字段映射介绍:存储种子酶的氨基酸序列数据。
  • 3_GraftM_packages.tar
  • 文件格式:TAR
  • 字段映射介绍:包含用GraftM创建的HMM包文件夹,其中精度<0.95的HMM包外文件夹名称以“x”前缀开头,如“xA0A0D3MTJ6”。

适用场景

  • 塑料降解酶研究: 分析种子酶的氨基酸序列,探索其降解塑料的分子机制。
  • 微生物降解潜力分析: 利用HMM模型在环境宏基因组数据中搜索潜在的塑料降解酶,评估微生物的降解能力。
  • 生物降解技术开发: 为新型塑料降解酶的发现及应用提供数据支持,助力塑料废弃物生物降解解决方案研发。
  • 环境微生物学研究: 研究全球生态系统中塑料降解微生物的分布特征及生态功能。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 38.27 MiB
最后更新 2026年2月9日
创建于 2026年2月9日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。