数据集概述
本数据集为温带适应冰鱼基因组学研究的补充数据，包含温带梭冰鱼（Champsocephalus esox）、南极姐妹种贡氏冰鱼（Champsocephalus gunnari）及外类群巴塔哥尼亚鳚鱼的基因组组装与注释文件，用于分析温带适应的遗传机制，涉及染色体结构、选择通路及抗冻基因演化等内容。
文件详解
- 说明文档：
- README.pdf：PDF格式，提供数据集背景、内容及使用说明
- README.md：Markdown格式，数据集的文本说明文档
- 基因组组装文件：
- ceso.ftc.fv8.fa.gz：梭冰鱼基因组序列文件，FASTA.gz格式
- cgun.ftc.fv8.fa.gz：贡氏冰鱼基因组序列文件，FASTA.gz格式
- ceso.ftc.fv8.agp.gz：梭冰鱼基因组组装结构文件，AGP.gz格式
- cgun.ftc.fv8.agp.gz：贡氏冰鱼基因组组装结构文件，AGP.gz格式
- 注释文件：
- emac.rtc.rv5.gtf.gz：巴塔哥尼亚鳚鱼基因组注释文件，GTF.gz格式
- 蛋白质序列文件：
- ceso.ftc.fv8.protein.fa.gz：梭冰鱼蛋白质序列文件，FASTA.gz格式
- cgun.ftc.fv8.protein.fa.gz：贡氏冰鱼蛋白质序列文件，FASTA.gz格式
适用场景
- 极地鱼类基因组演化研究：分析冰鱼从南极到温带环境的适应性遗传机制
- 生物适应性进化分析：探究线粒体、铁转运、光感知等通路在温带适应中的选择作用
- 抗冻基因演化研究：研究温带冰鱼抗冻糖蛋白假基因化及基因 translocation 现象
- 气候变化生物学研究：评估南极鱼类对环境变化的适应潜力
- 比较基因组学分析：对比温带与南极冰鱼基因组结构与功能差异
