纹状体多巴胺神经元突触图谱数据集

数据集概述

本数据集包含纹状体多巴胺神经元突触图谱的原始数据、PSC大小预测的Python脚本及预测结果。数据围绕Chuhma等人的研究展开,涵盖实验原始数据、3D网格位置信息、深度学习预测模型代码及多组重复预测结果,为神经突触功能分析提供支持。

文件详解

  • 根目录文件:
  • raw_data (NC).xlsx: Excel格式文件,包含多个工作表,每个工作表对应一个数据集,存储其他所有原始数据。
  • GluF_ChI_pred.py: Python源代码文件,用于基于PSC记录原始数据训练深度学习模型,实现PSC大小预测,示例使用ChIs的iGluR响应数据(Glu_fast_ChI.csv)作为训练集。
  • Raw data PSC mapping/目录:
  • 多个CSV格式文件: 用于图3的原始数据,也用于PSC大小预测(图4及Python脚本),例如GABA_ChI.csv、Glu_fast_ChI.csv等。
  • grid_150um.csv: CSV格式文件,包含150微米立方网格点阵的3D位置信息。
  • PSC size predictions/目录:
  • 多个CSV格式文件: 每种受体/细胞类型的PSC大小预测结果,包含一百次重复数据,用于研究论文,例如D2_ChI_predPSC.csv、GABA_dSPN_predPSC.csv等。
  • 核心字段示例(预测结果文件): AP、ML、DV(三维坐标),PSC_0至PSC_27等(多次重复预测的PSC大小值)。

适用场景

  • 神经科学研究: 分析纹状体多巴胺神经元突触的分布特征与功能机制。
  • 深度学习应用: 基于PSC记录数据训练模型,预测不同受体/细胞类型的PSC大小。
  • 突触功能分析: 探究3D空间位置对突触后电流(PSC)大小的影响规律。
  • 神经生物学实验复现: 复现Chuhma等人研究中的PSC映射与预测分析过程。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 20.81 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。