数据集概述
本数据集包含Gentile等人研究中支持WFS1参与GnRH神经元发育的原始数值数据,对应主文及补充材料中图表的量化结果,涉及Western blot条带密度分析、荧光素酶实验、RT-qPCR基因表达检测、荧光像素面积统计、轴突长度测量及胚胎形态学分析等实验数据,为研究WFS1缺陷通过ER应激反应影响GnRH发育提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:
Supporting Data Values Gentile et al..xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含多个子数据集,对应研究中的关键实验图表:
- FIG.1I:Western blot条带光密度量化值(WFS1质粒强度以β-肌动蛋白为内参归一化,结果为三次独立实验的均值±SEM)
- FIG.1J:体外荧光素酶实验RLU值(三次独立实验的均值±SEM)
- FIG.1K-Q:RT-qPCR检测BIP、ATF6、IRE1、PERK、ATF4、XBP1、CHOP mRNA表达量(ddCT法分析,GAPDH为内参,以WT转录水平为1,三次独立实验的均值±SEM)
- FIG.2D-E:不同脑区绿色荧光蛋白像素面积量化值(OBs、AC、POA、Re、Hy区域,至少10个胚胎的均值±SEM,三次独立实验)
- FIG.5A-G:RT-qPCR检测胚胎中bip、atf6、ire1、perk、atf4、xbp1、chop mRNA表达量(ddCT法分析,eef1a1为内参,以stdMO转录水平为1,三次独立实验的均值±SEM)
- FIG.6E:轴突长度量化值(嗅觉及后脑区域,至少12个胚胎的均值±SEM,三次独立实验)
- FIG.S2C:胚胎形态学统计(正常、中度、重度形态占比,至少250个胚胎的均值±SEM,五次独立实验)
数据来源
Gentile等人的研究
适用场景
- 分子生物学机制研究:分析WFS1缺陷对GnRH神经元发育的影响及ER应激反应在其中的作用
- 基因表达调控分析:通过RT-qPCR数据研究BIP、ATF6等ER应激相关基因的表达变化
- 蛋白质表达分析:利用Western blot量化数据探究WFS1蛋白表达水平的变化
- 细胞功能研究:通过荧光素酶实验数据研究WFS1对基因转录调控的影响
- 胚胎发育研究:分析胚胎形态学及轴突发育数据,探究WFS1缺陷对神经系统发育的影响