数据集概述
本数据集围绕北美广布的异世代瘿蜂Belonocnema treatae展开,调查其体内沃尔巴克氏体(Wolbachia)的感染模式与多样性,分析感染与地理分布、寄主植物关联、生活史周期及线粒体进化史的关系。包含463个个体的筛查结果、线粒体DNA及沃尔巴克氏体序列等数据,共4个文件,用于揭示该系统复杂的内共生菌感染动态。
文件详解
- mtDNA Sequences.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Belonocnema treatae的线粒体细胞色素氧化酶I基因(COI)序列数据,用于分析宿主的线粒体单倍型多样性及东西部进化支系分化。
- Wolbachia Sequences.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含沃尔巴克氏体的wsp基因序列数据,用于分析菌株多样性(wTre1-4)及系统发育关系。
- sample overview.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含样本的基本信息概览,可能涉及地理分布、寄主植物关联、生活史世代(有性/无性)、感染状态等元数据。
- Cloning Sequences.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含克隆获得的序列数据,用于验证沃尔巴克氏体菌株的存在及多样性,特别是多重感染情况。
数据来源
论文“Diversity and distribution of Wolbachia in relation to geography, host plant affiliation and life cycle of a heterogonic gall wasp”
适用场景
- 昆虫-内共生菌相互作用研究: 分析沃尔巴克氏体在Belonocnema treatae中的感染率、菌株多样性及传播动态。
- 地理种群遗传结构分析: 结合线粒体DNA序列数据,研究宿主种群的地理分化与沃尔巴克氏体感染的关联。
- 寄主-共生菌协同进化研究: 探讨沃尔巴克氏体菌株与宿主线粒体单倍型的关联,分析其在宿主生殖隔离中的潜在作用。
- 微生物生态学研究: 分析不同地理种群中沃尔巴克氏体的分布模式及多重感染(双重、三重)的生态意义。
- 进化生物学研究: 基于wsp基因和COI基因序列,重建沃尔巴克氏体与宿主的系统发育关系及共同进化历史。