数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB503品系(sng-1基因ok234突变体)的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。包含实验的基本信息、视频参数、分析软件及结果文件,记录了成年雌雄同体线虫在特定培养基上的行为数据,用于研究sng-1基因对其行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:sng-1 (ok234)X on food R_2011_09_13__12_02_4183.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始数据,包含视频帧信息、线虫轮廓与骨架数据等
- 特征数据文件
- 文件名称:sng-1 (ok234)X on food R_2011_09_13__12_02_4183_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件分析得到的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体弯曲度等量化指标
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:sng-1 (ok234)X on food R_2011_09_13__12_02_4183.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,遵循wcon格式标准,包含行为事件时序记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析sng-1基因ok234突变体的行为表型,探究该基因对秀丽隐杆线虫运动能力的影响
- 生物行为学分析: 基于视频数据和特征参数,研究线虫在特定环境下的运动模式、速度与身体弯曲特征
- 基因-行为关联分析: 对比突变体与野生型线虫的行为差异,揭示sng-1基因在行为调控中的作用机制
- 实验方法验证: 参考本实验的protocol,优化线虫行为实验的操作流程与数据分析方法
- 生物信息学工具测试: 利用数据集验证tierpsy等线虫行为分析软件的准确性与稳定性