数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了FX2173品系(携带ocr-4(tm2173)IV基因突变)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。实验由MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频处理后的行为特征数据,可用于研究ocr-4基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ocr-4 (tm2173) on food L_2010_03_25__12_1435.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件,具体内容未提供预览
- 特征数据文件
- 文件名称:ocr-4 (tm2173) on food L_2010_03_25__12_1435_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,由tierpsy软件生成,包含17763个分割骨架的特征信息
- 实验数据文件
- 文件名称:ocr-4 (tm2173) on food L_2010_03_25__12_1435.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录实验基础数据,包括总时长(899.3秒)、帧率(20.0帧/秒)、视频像素分辨率(4.02599微米/像素)等参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ocr-4基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 行为遗传学实验验证: 验证基因突变体与野生型线虫的行为差异
- 线虫行为特征分析: 基于tierpsy软件提取的特征数据,研究线虫的运动模式、速度等行为指标
- 神经生物学研究: 探究ocr-4基因相关的神经机制对行为的影响
- 实验方法学参考: 参考MRC实验室的实验方案,优化线虫行为实验设计