数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB2489品系(携带ins-15基因ok3444等位基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的行为特征,包含视频追踪原始数据及处理后的行为特征数据,可用于研究ins-15基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
ins-15 (ok3444)II on food R_2011_05_19__15_17_55___1___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的WCON格式压缩文件,记录线虫运动的时空坐标等原始轨迹数据
- 文件名称:
ins-15 (ok3444)II on food R_2011_05_19__15_17_55___1___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、弯曲频率、身体姿态等量化特征
- 文件名称:
ins-15 (ok3444)II on food R_2011_05_19__15_17_55___1___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频追踪的原始数据,如帧序列、线虫骨架分割数据(共26830个分割骨架)、像素与微米的映射关系(4.33597微米/像素)等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析ins-15基因ok3444突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析: 研究成年雌雄同体线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为等特征
- 神经生物学机制探索: 结合基因功能,探究ins-15基因调控线虫行为的神经分子机制
- 行为数据分析方法验证: 基于标准化的线虫行为数据,验证行为特征提取算法的有效性
- 遗传学与行为学关联研究: 建立基因变异与行为表型之间的关联,为相关疾病(如代谢性疾病)的机制研究提供参考