数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录MT2248品系(携带egl-47(n1081)V突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年5月开展,包含视频追踪原始数据、行为特征提取结果等,可用于分析该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:egl-47 (n1081)V on food R_2010_05_11__12_04_2444_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,基于tierpsy软件分析生成,涉及运动轨迹、姿态等行为参数
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:egl-47 (n1081)V on food R_2010_05_11__12_04_2444.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录线虫行为视频的原始追踪数据,包含19329个分段骨架数据,帧率为每秒25.38帧
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:egl-47 (n1081)V on food R_2010_05_11__12_04_2444.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,包含实验时长、像素分辨率等元数据(视频分辨率为每像素4.7068微米,实验总时长约900秒)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析egl-47基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 线虫行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、姿态变化等行为特征
- 行为实验方法验证:参考实验方案(遵循E. Yemini等人的方法)优化秀丽隐杆线虫行为实验设计
- 生物信息学工具应用:验证tierpsy软件在线虫行为特征提取中的有效性与准确性