数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了NL335品系(gpa-3(pk35)V基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂平板中进行,使用tierpsy软件追踪,包含视频及处理后的特征数据,可用于分析线虫基因相关的行为模式。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:gpa-3 (pk35)IV on food L_2010_03_04__11_4339.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,如视频帧对应的线虫形态、位置等基础信息
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-3 (pk35)IV on food L_2010_03_04__11_4339_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,基于17753个分割骨架生成,对应实验总时长899.3秒、帧率20.0帧/秒的追踪结果
- 压缩数据文件
- 文件名称:gpa-3 (pk35)IV on food L_2010_03_04__11_4339.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件,可能涉及标准化行为数据格式(wcon)的相关内容
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-3基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 生物行为学实验验证: 基于标准化实验方案的线虫行为数据,支持行为学研究的可重复性验证
- 模式生物行为特征分析: 利用提取的行为特征数据,探究线虫运动、觅食等行为的量化指标
- 基因与环境互作研究: 结合实验环境参数(如食物、培养基),分析基因在特定环境下的行为表型