数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT2246品系(携带egl-43(n1079)II突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年8月开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的运动行为特征,可用于研究egl-43基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food R_2010_08_06__12_36_4586_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动相关特征(基于14396个分割骨架数据)
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food R_2010_08_06__12_36_4586.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据,格式遵循wcon标准(线虫行为数据交换格式)
- 核心数据文件
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food R_2010_08_06__12_36_4586.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,对应总时长898.967秒、帧率30.03帧/秒、像素分辨率4.52963微米/像素的行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-43基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 行为学实验方法验证: 基于Yemini等的实验方法,验证线虫行为学实验的标准化流程
- 生物图像分析算法优化: 利用分割骨架数据和特征文件,优化线虫行为特征提取算法
- 模式生物行为数据库构建: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为数据的整合分析