数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)QL19 ins-12(tm2918)菌株的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为表现,包括运动轨迹、骨架分割等特征,是线虫基因功能与行为研究的基础数据。
文件详解
- 文件名称:ins-12 (tm2918) on food L_2012_10_31__11_05_1954_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,可能涉及运动轨迹、速度、弯曲度等由tierpsy软件提取的特征参数
- 文件名称:ins-12 (tm2918) on food L_2012_10_31__11_05_1954.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始数据或基础处理数据,可能涉及视频帧、线虫位置坐标等底层信息
- 文件名称:ins-12 (tm2918) on food L_2012_10_31__11_05_1954.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,可能遵循线虫行为数据交换标准,包含标准化的行为轨迹信息
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ins-12(tm2918)突变体与野生型线虫的行为差异,探究ins-12基因对行为的调控作用
- 行为表型分析: 基于运动轨迹、骨架分割等数据,研究线虫的觅食、运动模式等行为特征
- 基因与环境互作研究: 分析线虫在含食物环境中的行为响应,探讨基因与环境因素对行为的共同影响
- 生物信息学算法验证: 作为tierpsy等行为分析软件的测试数据,验证行为特征提取算法的准确性