数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了QL24品系ins-5(tm2560)突变体线虫的行为实验数据。实验于2012年11月8日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为视频及分析结果,涉及实验条件、线虫特征、行为参数等信息,可用于研究ins-5基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ins-5 (tm2560) on food R_2012_11_08__12_34_0958.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的wcon格式数据压缩包,记录线虫运动的时空坐标等基础行为信息
- 特征数据文件
- 文件名称:ins-5 (tm2560) on food R_2012_11_08__12_34_0958_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,包含由tierpsy软件分析得到的运动特征参数
- 实验主数据文件
- 文件名称:ins-5 (tm2560) on food R_2012_11_08__12_34_0958.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验完整数据,涵盖视频采集参数(帧率、像素分辨率)、线虫骨架分割数据(26127个分割骨架)、实验时长(898.967秒)等核心信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析ins-5(tm2560)突变体与野生型线虫的行为差异,探究ins-5基因功能
- 行为表型分析:基于线虫运动轨迹、骨架数据研究其运动模式、趋化性等行为特征
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为学实验的可重复性
- 生物信息学工具测试:使用tierpsy软件分析结果,评估该工具在线虫行为特征提取中的性能
- 模式生物行为数据库构建:补充秀丽隐杆线虫行为数据库,支持大规模线虫行为数据的整合分析