数据集概述
本数据集围绕现存小嘴贝目腕足动物的形态与分子数据联合分析展开，包含形态特征矩阵、核糖体DNA序列及系列系统发育分析结果，用于探究形态与分子数据的系统发育信号冲突，评估形态系统学在该类群中的适用性。
文件详解
- 文档类文件（.docx格式，共5个）：
- Appendix_1_05-11-17.docx、Appendix_2_05-11-17.docx、Appendix_3_05-11-17.docx、Appendix_4_05-11-17.docx：研究附录文件，可能包含补充方法、数据说明或结果细节
- 代码类文件（.R格式，共5个）：
- test_which_parsimony_informative_01-16-17.R：简约性信息位点测试脚本
- make_runI_06-29-15.R：分析运行文件生成脚本
- figures_for_EvolTalk_06-20-16.R：进化相关图表生成脚本
- figures_rhynchComb_08-03-16.R：小嘴贝联合分析图表生成脚本
- write_simple_sumt_01-16-17.R：系统发育树总结输出脚本
- 数据与结果文件：
- datafiles.zip：数据压缩包，可能包含原始形态矩阵、分子序列等核心数据
- raw_morphMat_MrBayes_04-21-17.nex：MrBayes格式的原始形态特征矩阵文件
- rhynchComb_workspace_07-25-2016.Rdata：R语言工作空间文件，存储分析中间结果
- 报告与图表文件（.pdf格式，共4个）：
- rhynchComb_07-25-16.pdf：联合分析主报告
- run_coding_12-15-16a.pdf：分析编码说明文件
- SuppMat_allTreesPlotted_suppFigures.pdf：所有系统发育树绘图补充材料
- 代码压缩包（.zip格式）：
- runFiles.zip、runScripts.zip：分析运行脚本压缩包
- 说明文件：
- README.txt：数据集说明文档，包含文件结构、分析背景及命名规则解释
适用场景
- 系统发育学研究：用于分析形态与分子数据的系统发育信号冲突，验证联合分析方法的有效性
- 腕足动物分类学研究：评估形态特征在小嘴贝目高级阶元分类中的可靠性
- 进化生物学分析：探究现存小嘴贝目形态趋同演化模式及分子系统发育关系
- 生物信息学方法验证：测试简约法、贝叶斯法等系统发育算法在多数据 partition 下的表现
- 古生物学应用：为化石小嘴贝目分类提供现存类群的分子系统发育框架参考
