数据集概述
本数据集为线粒体蛋白异常变化检测与原始猿类低代谢研究的补充文件，包含六份补充图表和八份补充数据文件，涵盖OXPHOS复合物θevo值分析、线粒体蛋白替代倾向差异等内容，支持研究核心结论。
文件详解
该数据集包含补充图表和补充数据文件两类，具体说明如下：
- 补充图表文件（PDF格式）：
- Akpinar_et_al_Supplementary_Fig_1.pdf：各OXPHOS复合物边缘θevo值计算结果
- Akpinar_et_al_Supplementary_Fig_2.pdf：哺乳动物目级OXPHOS复合物线粒体蛋白替代倾向中位数分析
- Akpinar_et_al_Supplementary_Fig_3.pdf：哺乳动物目级OXPHOS复合物线粒体蛋白替代倾向中位数置信区间分析
- Akpinar_et_al_Supplementary_Fig_4.pdf：哺乳动物科级OXPHOS复合物线粒体蛋白替代倾向中位数计算结果
- Akpinar_et_al_Supplementary_Fig_5.pdf：哺乳动物科级OXPHOS复合物线粒体蛋白替代倾向中位数置信区间（按90%下限排序）
- Akpinar_et_al_Supplementary_Fig_6.pdf：哺乳动物科级OXPHOS复合物线粒体蛋白替代倾向中位数置信区间（按90%上限排序）
- 补充数据文件：
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_1.csv：含比对位置、蛋白、边缘名称、祖先/后代节点、特征、分支长度、总替代得分等字段的蛋白替代数据
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_2.xlsx：各线粒体蛋白比对位置的TSS计算结果
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_3.xlsx：全线粒体编码位置及特定OXPHOS复合物的SPCS和θevo输出
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_4.gb：哺乳动物及爬行动物mtDNA的GenBank文件
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_5.nwk：哺乳动物mtDNA编码序列的最大似然推断树
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_6.nwk：含Felsenstein自举比例的哺乳动物mtDNA最大似然树
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_7.nwk：含转移自举期望的哺乳动物mtDNA最大似然树
- Akpinar_et_al_Supplemental_File_8.nwk：PAGAN树输出文件
适用场景
- 进化生物学研究：分析哺乳动物线粒体蛋白替代的进化模式与OXPHOS复合物功能关联
- 代谢生物学研究：探究原始猿类低代谢现象的线粒体分子机制
- 生物信息学分析：验证线粒体蛋白序列比对与进化树构建方法的有效性
- 比较基因组学研究：揭示不同分类阶元（目、科）线粒体基因的进化差异
