数据集概述
该数据集包含小麦族（Triticeae）的叶绿体基因组与核基因座系统发育数据，围绕系统发育关系解析及网状进化展开，包含多种格式的序列、拓扑结构及分析结果文件，为小麦族系统发育研究提供支持。
文件详解
- 说明文档类：
- ReadMe.txt、ReadMe_2.txt：文本文档，提供数据集说明
- Dataset_Information.xlsx：Excel文件，数据集信息汇总
- 序列设计文件：
- 18048_blocks_bait_design.fasta：FASTA格式，18048个外显子区块诱饵设计序列
- 58566_baits_120bp.fas：FAS格式，58566条120bp长度的诱饵序列
- 系统发育树文件（.mltree格式）：
- 染色体水平系统发育树：如bestTree.chromosome1.MLTree、bestTree.chromosome_1long_concat.MLTree等（共21个文件）
- 核基因串联树：如nuclear_bestTree.Concatenated_NoAvena_NoMissing_MinusParalogous.MLTree.txt
- 叶绿体基因组树：如cpDNA_bestTree.76cds_codon_NoElymus_ml
- 序列比对与字符集文件（.nex格式）：
- Chloroplast_76CodingGenes_GeneCharsets.nex：叶绿体76个编码基因字符集
- 895_MappedLoci_AllTaxa_ChromCharsets.nex：895个定位基因的染色体字符集
- 1046_Loci_AllTaxa_LocusCharsets.nex：1046个基因座的字符集
- 其他分析文件：
- NuclearLoci_MLTopologies_Bootstrap.pdf：核基因座最大似然拓扑结构及自举分析PDF文档
适用场景
- 小麦族（Triticeae）系统发育关系研究
- 植物基因组网状进化分析
- 叶绿体基因组与核基因座进化比较研究
- 分子系统学方法在禾本科植物中的应用验证
- 作物亲缘关系与遗传多样性分析
