数据集概述
该数据集包含ATAC-seq实验产生的原始测序读数、识别的峰值及差异可及性区域，围绕细胞表面与细胞内免疫受体激活条件展开，为研究免疫激活相关的染色质可及性变化提供数据支持。
文件详解
该数据集包含11个文件，具体说明如下：
- 差异可及性区域文件（.tsv格式，共4个）：
- DataSet6.wt_a4_4h_vs_wt_mk_4h_DARs.tsv：野生型a4与mk组4小时差异可及区域数据，字段包括logFC、logCPM、LR、PValue、FDR、Geneid、Chr、Start、End等
- DataSet9.setikv_est_vs_setikv_mk_DARs.tsv：setikv est与mk组差异可及区域数据，字段同上
- DataSet7.wt_kv_4h_vs_wt_mk_4h_DARs.tsv：野生型kv与mk组4小时差异可及区域数据
- DataSet8.setiwt_est_vs_setiwt_mk_DARs.tsv：setiwt est与mk组差异可及区域数据
- 峰值注释文件（.html格式，共4个）：
- DataSet5.setikv_Peak_Annotation.html：setikv组峰值注释报告
- DataSet4.setiwt_Peak_Annotation.html：setiwt组峰值注释报告
- DataSet3.wt_Peak_Annotation.html：野生型组峰值注释报告
- DataSet1.ATACseqQC.html：ATAC-seq质量控制报告
- 综合数据文件：
- DataSet2.Consensus_peaks.zip：共识峰值压缩文件
- Table1.ATACseq_sample_summary.xlsx：ATAC-seq样本信息汇总表
- ATAC_seq_dataset.pdf：数据集说明文档
适用场景
- 免疫生物学研究：分析免疫受体激活对染色质可及性的调控机制
- 表观遗传学分析：探究不同免疫激活条件下的差异染色质区域功能
- 基因调控研究：结合差异可及区域数据解析免疫相关基因的表达调控
- 实验方法验证：基于ATAC-seq质量控制及峰值注释数据优化实验流程
