细胞迁移与ERK信号数据集

数据集概述

该数据集包含ERK信号表达细胞与细胞核染色的追踪视频数据,通过TrackMate工具追踪后使用MATLAB进行分析,记录了细胞迁移过程中的运动轨迹、连接关系及相关量化指标,为细胞生物学研究提供支持。

文件详解

  • 数据文件(CSV格式):
  • CellMigration_WithERK-edges.csv:包含细胞迁移轨迹的连接关系数据,字段包括TRACK_ID(轨迹ID)、SPOT_SOURCE_ID(源点ID)、SPOT_TARGET_ID(目标点ID)、SPEED(速度)、DISPLACEMENT(位移)等
  • CellMigration_WithERK-tracks.csv:包含细胞迁移轨迹的整体信息,字段包括TRACK_INDEX(轨迹索引)、NUMBER_SPOTS(点数量)、TRACK_DURATION(轨迹时长)、TRACK_DISPLACEMENT(轨迹位移)等
  • CellMigration_WithERK-spots.csv:可能包含细胞迁移过程中追踪点的详细信息
  • 元数据文件(XML格式):
  • CellMigration_WithERK.xml:记录数据集的元数据信息
  • 代码文件(.m格式):
  • CellMigration_WithERK.m:MATLAB分析代码文件
  • 图像文件(.tif格式):
  • CellMigration_WithERK.tif:细胞迁移实验的TIFF图像文件
  • 截图文件(.png格式):
  • A_CellMigration_WithERK-screenshot.png:数据集相关的截图文件

适用场景

  • 细胞生物学研究:分析ERK信号对细胞迁移行为的影响
  • 生物信息学分析:验证细胞追踪算法(如TrackMate)的准确性与有效性
  • 计算生物学建模:基于细胞迁移轨迹数据构建运动模型
  • 生物图像处理教学:作为细胞追踪与分析的案例数据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 929.34 MiB
最后更新 2025年12月22日
创建于 2025年12月22日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。