数据集概述
该数据集包含ERK信号表达细胞与细胞核染色的追踪视频数据,通过TrackMate工具追踪后使用MATLAB进行分析,记录了细胞迁移过程中的运动轨迹、连接关系及相关量化指标,为细胞生物学研究提供支持。
文件详解
- 数据文件(CSV格式):
- CellMigration_WithERK-edges.csv:包含细胞迁移轨迹的连接关系数据,字段包括TRACK_ID(轨迹ID)、SPOT_SOURCE_ID(源点ID)、SPOT_TARGET_ID(目标点ID)、SPEED(速度)、DISPLACEMENT(位移)等
- CellMigration_WithERK-tracks.csv:包含细胞迁移轨迹的整体信息,字段包括TRACK_INDEX(轨迹索引)、NUMBER_SPOTS(点数量)、TRACK_DURATION(轨迹时长)、TRACK_DISPLACEMENT(轨迹位移)等
- CellMigration_WithERK-spots.csv:可能包含细胞迁移过程中追踪点的详细信息
- 元数据文件(XML格式):
- CellMigration_WithERK.xml:记录数据集的元数据信息
- 代码文件(.m格式):
- CellMigration_WithERK.m:MATLAB分析代码文件
- 图像文件(.tif格式):
- CellMigration_WithERK.tif:细胞迁移实验的TIFF图像文件
- 截图文件(.png格式):
- A_CellMigration_WithERK-screenshot.png:数据集相关的截图文件
适用场景
- 细胞生物学研究:分析ERK信号对细胞迁移行为的影响
- 生物信息学分析:验证细胞追踪算法(如TrackMate)的准确性与有效性
- 计算生物学建模:基于细胞迁移轨迹数据构建运动模型
- 生物图像处理教学:作为细胞追踪与分析的案例数据