数据集概述
本数据集为研究新大陆锥头蝗科(直翅目昆虫)起源的相关分析数据,包含系统发育分析、生物地理建模等多种方法所需的输入文件、结果文件及辅助文档,支持该类群起源与演化的学术研究。
文件详解
该数据集包含三十七个文件,覆盖多种分析类型,具体如下:
- 系统发育分析相关文件:
- New_Pyrgomorphidae2.phy、New_Pyrgomorphidae2.nex:系统发育分析输入文件(如MrBayes、RAxML软件格式)
- RAxML_bestTree.txt、pyrgomorph.newick、raxmltre.newick:系统发育树结果文件(Newick格式)
- New_Pyrgomorphidae.tnt:TNT软件系统发育分析文件
- 生物地理建模相关文件:
- Pyrgomorphidae_geog.data:地理分布数据文件
- Pyrgomorphidae_DEC+J_unconstrained_v1.Rdata、Pyrgomorphidae_BAYAREALIKE+J_unconstrained_v1.Rdata:生物地理模型(如DEC、BAYAREALIKE)分析结果文件(R数据格式)
- Pyrgomorphidae_BAYAREALIKE_vs_BAYAREALIKE+J_unconstrained_v1.pdf:生物地理模型比较结果文档(PDF格式)
- 时间校准分析相关文件:
- New_Pyrgomorphidae2_MrBayes_time.nex:带时间校准的MrBayes分析输入文件
- pyrgomorph_timetree.tre:时间树结果文件(Tree格式)
- 综合数据与辅助文件:
- On the origin of NW data.xlsx:综合数据表格(Excel格式)
- best_scheme.txt:分析参数设置记录文件
- restable.txt、restable_AICc_rellike_formatted.txt:模型选择结果文件
适用场景
- 昆虫系统发育研究:用于重建锥头蝗科的演化关系
- 生物地理学分析:探究新大陆锥头蝗科的起源地与扩散路径
- 分子演化模型比较:评估不同演化模型对该类群数据的拟合效果
- 直翅目昆虫演化历史研究:辅助解析锥头蝗科的时间分化节点