数据集概述
本数据集是论文《Analyzing and Modeling the Spread of SARS-CoV-2 Omicron Lineages BA.1 and BA.2, France, September 2021–February 2022》的补充数据压缩包，包含支撑论文图表和表格的分析脚本与对应数据文件，用于辅助理解法国奥密克戎BA.1、BA.2变异株的传播特征与建模结果。
文件详解
- 压缩包文件
- 文件名称：data_EID_Omicron.zip
- 文件格式：ZIP
- 包含内容：压缩包内包含3个R分析脚本和3个CSV数据文件，具体对应关系为：
- Script_EID_1.R：用于分析data_EID1.csv筛查测试数据（支撑Figure 1、Suppl Figure F1、Tables 1和3）
- Script_EID_2.R：用于分析data_EID2.csv筛查测试数据（支撑Figures 2、3、5、Suppl Figure F2、Table 2）
- Script_EID_sequencing_raw.R：用于分析data_EID_sequencing.csv测序数据（支撑Figures 4、5、Suppl Figure F3）
数据来源
论文《Analyzing and Modeling the Spread of SARS-CoV-2 Omicron Lineages BA.1 and BA.2, France, September 2021–February 2022》（发表于Emerging Infectious Diseases，doi:10.3201/eid2807.220033）
适用场景
- 传染病传播动力学研究：基于筛查测试数据和测序数据，分析奥密克戎BA.1、BA.2变异株在法国的传播趋势与流行特征
- 病毒变异株监测：利用测序数据探究奥密克戎不同亚谱系的分布与演化规律
- 流行病学模型验证：通过R脚本复现论文中的传播模型，验证模型参数与拟合效果
- 公共卫生策略评估：结合传播分析结果，为奥密克戎变异株流行期间的防控策略制定提供数据支持
