新冠病毒大流行背景下深度学习与物理对接工具对比数据集

数据集概述

该数据集围绕新冠病毒大流行背景,提供深度学习与物理对接工具的相关数据,包含数据预处理脚本、不同对接工具的结果文件、多序列比对文件及模拟输入文件等,为相关研究提供数据支持。

文件详解

  • DataProcessing.zip:压缩文件,包含数据预处理的脚本及中间文件,用于从pdb文件中提取SMILES和蛋白质坐标
  • docking-gnina.zip:压缩文件,包含GNINA对接工具的结果数据
  • docking-vina.zip:压缩文件,包含AutoDock Vina对接工具的结果数据
  • a3m_file.zip:压缩文件,包含用于Boltz2的多序列比对文件
  • Boltz2_input.zip:压缩文件,包含Boltz-2对接模拟的输入文件及参数设置
  • Boltz2-dock-aligned.zip:压缩文件,包含Boltz2的对齐对接构象数据

适用场景

  • 药物研发研究:对比深度学习与物理对接工具在新冠病毒相关分子对接中的表现
  • 计算生物学分析:分析不同对接工具的结果差异,优化药物分子设计流程
  • 生物信息学工具评估:评估GNINA、AutoDock Vina、Boltz2等对接工具的性能
  • 新冠病毒研究:为新冠病毒及未来冠状病毒的药物研发提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 497.06 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。