数据集概述
该数据集围绕性状进化相关速率的估计与不确定性展开，包含基于系统发育树的进化分析方法、模拟研究结果及实证案例（鱼类口部形态与安乐蜥辐射进化），为探究进化整合模式变化对表型进化轨迹的影响提供数据支持。
文件详解
- 实证分析文件：
- Caetano_Harmon_2018_Empirical_analyses.pdf：PDF格式，实证分析结果文档
- Caetano_Harmon_2018_Empirical_analyses.Rmd：R Markdown格式，实证分析代码文档
- 模拟研究文件：
- Caetano_Harmon_2018_Simulation_study.pdf：PDF格式，模拟研究结果文档
- Caetano_Harmon_2018_Simulation_study.Rmd：R Markdown格式，模拟研究代码文档
- 剪枝算法示例文件：
- Caetano_Harmon_2018_pruning_example.pdf：PDF格式，剪枝算法示例文档
- Caetano_Harmon_2018_pruning_example.Rmd：R Markdown格式，剪枝算法示例代码文档
- 补充材料文件：
- Supplementary_Tables_and_Figures.pdf：PDF格式，补充表格与图表文档
- 模拟数据压缩包：
- 25_species_3_traits.zip、50_species_3_traits.zip、200_species_3_traits.zip、500_species_6_traits.zip、1000_species_6_traits.zip、200_species_6_traits.zip等：ZIP格式，不同物种数量与性状数量组合的模拟数据集
- MCMC结果文件：
- anoles_MCMC_results.RData：R数据格式，安乐蜥MCMC分析结果
- centrarchidae_MCMC_results.RData：R数据格式，鲈科鱼类MCMC分析结果
适用场景
- 进化生物学研究：分析系统发育树中性状进化的相关速率及不确定性
- 形态进化分析：探究物种形态特征（如鱼类口部形态）的进化轨迹
- 生物地理学研究：研究岛屿辐射物种（如安乐蜥）的性状进化模式
- 统计方法验证：验证贝叶斯MCMC方法在进化参数估计中的性能
- 系统发育数据分析：扩展费尔森斯坦剪枝算法在多变量布朗运动模型中的应用
