数据集概述
本数据集围绕锌抗病毒蛋白（ZAP）对感染脊椎动物RNA病毒基因组组成的影响展开，包含系统发育分析、蛋白结构、病毒组成等多维度数据，支撑研究ZAP起源进化及与病毒基因组CpG抑制的关联。
文件详解
该数据集包含多个目录及文件，具体说明如下：
- 病毒组成数据（Viral composition/ 目录）：
- ssRNA_viruses_info.csv：CSV格式，包含病毒分类、宿主、基因组大小、碱基组成等字段，如TaxID（分类ID）、Species（物种）、GC.（GC含量）、Size..Kb.（基因组大小）
- ssRNA_viruses_bias.csv：CSV格式，包含病毒二核苷酸频率数据，字段如TaxID、AA（二核苷酸AA频率）、AC（二核苷酸AC频率）等
- 系统发育分析文件（Phylogenetic analyses/ 目录）：
- Vert_PARP12-ZAP.90.fasta：FASTA格式，可能为PARP12-ZAP同源序列文件
- Vert_PARP12-ZAP.90.aln.fasta：FASTA格式，可能为PARP12-ZAP同源序列比对文件
- Vert_PARP12-ZAP.90.phylogeny.log：LOG格式，可能为系统发育分析日志文件
- Vert_PARP12-ZAP.90.constraint1.nwk：NWK格式，可能为系统发育树文件
- 蛋白结构文件（Protein structures/ 目录）：
- 8个PDB格式文件，如PARP12_Hsapiens.pdb（人类PARP12蛋白结构）、ZAP_Rbivittatum.pdb（某种ZAP蛋白结构）等，记录不同物种PARP12和ZAP蛋白的三维结构数据
适用场景
- 病毒进化研究：分析RNA病毒基因组组成与宿主ZAP蛋白的共进化关系
- 分子生物学研究：探究ZAP蛋白结构功能及与病毒RNA结合的分子机制
- 系统发育分析：追溯ZAP蛋白在脊椎动物中的起源与演化历程
- 抗病毒机制研究：研究宿主ZAP介导的免疫压力对病毒基因组CpG抑制的影响
