数据集概述
本数据集围绕迁徙鸟类雄性鸣声结构与后代繁殖种群招募的关系展开,包含雄性鹪鹩鸣声数据、基因型数据、繁殖适合度数据及相关分析代码与方法文档,为研究性选择对鸟类鸣声结构的影响提供多维度数据支持。
文件详解
- 数据文件(CSV格式):
- NS_y.csv:包含雄性个体ID、巢位数量、配对时间、后代数量及招募数量等适合度相关字段
- ADULTS_2019-2022.csv:记录2019-2022年成年个体的环志号、巢位、性别、日期等基础信息
- DiSciullo_et_al_HOWR_MSA_fitness.csv:繁殖适合度数据文件
- DiSciullo_et_al_HOWR_MSA_genotypes.csv:基因型数据文件
- Agena_Genotyping_PCR_Conditions.csv:基因分型PCR条件参数文件
- 代码与方法文件:
- DiSciullo_et_al_HOWR_MSA_Rcode.R:R语言分析代码
- Bioinformatics_Methods_and_Code.pdf:生物信息学方法与代码说明文档
- 测序与转录组文件:
- Trinity.SuperTrans.fasta、Trinity.fasta:转录组组装结果文件
- filtered_output2.vcf.gz:过滤后的基因型数据压缩文件
- final.thinned.tsv:精简后的基因型数据表格
- 说明文档:
- README.md:数据集整体说明文档
- HOWR-1.html、HOWR-2.html:HTML格式的补充说明文档
适用场景
- 行为生态学研究:分析雄性鸣声结构与繁殖适合度的关联
- 进化生物学研究:探究性选择对鸟类鸣声特征的塑造机制
- 分子生态学研究:结合基因型数据开展亲缘关系与繁殖成功率分析
- 生物信息学方法应用:验证多变量选择分析在鸟类研究中的适用性
- 迁徙鸟类种群动态研究:评估后代招募对种群维持的影响因素