数据集概述
本数据集包含用于实现状态空间伴随捕获再捕获整合模型(C-MOM)的代码与模型文件,支持复现相关研究分析。该模型可优化稀疏捕获再捕获数据的种群参数估计,适用于殖民或群居物种研究,需配合MARK软件运行。
文件详解
该数据集包含代码文件、模型文件及说明文档,具体如下:
- R代码文件(共46个,.r格式):按编号顺序运行,涵盖种群模拟、模型分析、参数计算等功能,示例文件包括:
- ! 1 - Simulating Population Dynamics HETERO.R:种群动态模拟
- ! 2 - C-MOM CMR 1P Analysis.R:C-MOM与CMR模型分析
- ! 6 Bias SE MSE Computation 2H.R:偏差、标准误及均方误差计算
- 模型文件(共4个,.bug格式,位于Models/目录):
- CMR2P.bug:经典捕获再捕获(CMR)模型文件
- C-MOM1P.bug、C-MOM2P.bug:状态空间伴随捕获再捕获整合模型(C-MOM)文件
- 说明文档:
- README.md:项目说明文档,含代码运行顺序、环境配置要求等
- 项目文件:
- dataAndCodesC-MOM.Rproj:R项目文件
适用场景
- 种群生态学研究:优化殖民或群居物种(如岩豚鼠)稀疏捕获再捕获数据的种群参数估计
- 统计模型验证:复现C-MOM模型与经典模型(CMR、ZPNE)的性能对比分析
- 生物统计学方法应用:探索状态空间模型在捕获再捕获研究中的实践价值
- 计算生态学教学:作为捕获再捕获模型代码实现的教学案例