系统发育多样性损失与随机树模型数据集

数据集概述

本数据集围绕系统发育多样性（PD）损失展开研究，通过三参数随机树模型分析拓扑结构、分支深度与灭绝风险对PD损失的影响，提出"危险区"参数范围及蒙特卡洛推断算法，并应用于鸟类支系数据验证。

文件详解

• 代码文件（.r格式）：
• InferenceFunctions.R：包含用于推断模型参数（β、α、η）的蒙特卡洛算法代码
• Simulation_ntagged.R：用于生成模拟系统发育树及相关数据的代码文件
• 文档文件（.pdf格式）：
• PDloss_appendix.pdf：可能包含研究方法、模拟结果或附录说明的补充文档

适用场景

• 生物多样性保护研究：分析物种灭绝对进化遗产（PD）损失的影响机制
• 系统发育模型优化：评估多参数随机树模型在模拟真实生物进化关系中的应用价值
• 濒危物种风险评估：识别易导致PD快速下降的"危险区"参数特征，指导保护优先级设定
• 计算生物学算法开发：验证蒙特卡洛参数推断方法在系统发育数据分析中的有效性