数据集概述
该数据集为“系统发育树中最小化到最近叶平均距离（ADCL）”研究提供支持，包含验证ADCL算法在嵌合序列等场景下行为的实验数据，涉及参考序列包、多序列比对、系统发育放置结果及嵌合序列标识等核心内容，助力相关算法性能评估与验证。
文件详解
该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下：
- 文档说明文件（.txt格式）：
- README_for_voronoi-validation.txt：Voronoi验证相关说明文档
- README_for_n-complexity.txt：n复杂度相关说明文档
- README_for_k-complexity.txt：k复杂度相关说明文档
- README_for_chimeras.txt：嵌合序列相关说明文档
- README_for_bootstrap.txt：bootstrap验证相关说明文档
- 压缩包文件（.zip格式）：
- n-complexity.zip：n复杂度相关数据压缩包
- voronoi-validation.zip：Voronoi验证相关数据压缩包
- k-complexity.zip：k复杂度相关数据压缩包
- chimeras.zip：嵌合序列相关数据压缩包
- bootstrap.zip：bootstrap验证相关数据压缩包
- PDF文件（.pdf格式）：
- voro_suppfig.pdf：Voronoi验证相关补充图表文档
- 核心序列数据（根据README内容）：
- sequences/enterobacteriaceae.refpkg：肠杆菌科参考序列包（含5个物种代表序列及UCHIME识别的嵌合序列）
- sequences/merged.sto：用于系统发育放置的多序列比对文件
- sequences/merged.jplace：系统发育放置结果文件
- sequences/chim_ids.txt：嵌合序列名称标识文件
适用场景
- 系统发育算法研究：用于评估ADCL算法与PAM等启发式算法在系统发育树优化任务中的性能差异
- 生物信息学验证：验证ADCL算法在嵌合序列选择场景下的有效性，对比随机子集与系统发育多样性最大化策略
- 宏基因组分析：为宏基因组reads的系统发育放置选择合适参考树序列提供数据支持
- 计算生物学实验：支持系统发育树中序列子集选择相关的复杂度分析与验证实验
