数据集概述
本数据集包含地理范围演化与物种分化相互作用的系统发育推断研究相关文件，涉及物种地理分布特征与谱系形成、灭绝过程的相互影响分析。数据支持新似然法模型的验证与应用，包含模拟测试及加州植物群落栖息地占据演化的分析文件，共11个文件。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称：arc-states.csv、cea-states.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录物种的地理状态或栖息地类型，如arc-states.csv包含Arctostaphylos属物种及其对应状态值（0/1）
- 文件名称：cea-trees.tre、arc-trees.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：物种系统发育树文件，分别对应Ceanothus属和Arctostaphylos属的演化树结构
- 文件名称：ArcCeaSupplementaryTable.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：补充表格，可能包含研究相关的辅助数据或统计结果
- 代码文件
- 文件名称：chaparral-analysis.R、simulation-analysis.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：分析脚本，分别用于模拟测试分析及加州植物群落（如chaparral栖息地）的演化分析
- 其他文件
- 文件名称：Arctostaphylos.nex、Ceanothus.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：系统发育分析数据文件，包含物种的特征矩阵或分类单元信息
- 文件名称：CeanothusBeastfile.xml、ArctostaphylosBeastfile.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST软件的配置文件，用于物种系统发育树的贝叶斯推断
数据来源
论文“Phylogenetic inference of reciprocal effects between geographic range evolution and diversification”
适用场景
- 系统发育与生物地理学研究: 分析地理范围演化与物种分化的相互作用机制
- 物种演化模型验证: 测试和应用新的似然法模型，估计区域依赖的物种形成、灭绝及范围演化速率
- 植物群落演化分析: 研究加州植物群落（如chaparral和森林栖息地）的物种形成速率及栖息地耐受性扩张
- 生物多样性动态研究: 探索谱系出生-死亡过程与地理分布特征的关联，支持比较分析方法的优化
