数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT2246品系egl-43(n1079)II基因突变体成虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中开展,通过视频跟踪获取线虫运动特征,包含原始跟踪、特征提取及标准化格式的三类文件,可用于分析该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
egl-43 (n1079)II on food L_2010_08_06__12_34_48___2___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为原始跟踪数据,可能涉及视频帧、骨架分割等基础信息
- 特征数据文件
- 文件名称:
egl-43 (n1079)II on food L_2010_08_06__12_34_48___2___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从原始数据中提取的线虫行为特征,如运动轨迹、速度、身体弯曲度等量化指标
- 标准化格式文件
- 文件名称:
egl-43 (n1079)II on food L_2010_08_06__12_34_48___2___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析egl-43基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 线虫行为学分析:基于视频跟踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度及身体姿态变化
- 行为实验方法验证:参考实验方案(如30分钟适应期、视频跟踪参数)优化秀丽隐杆线虫行为实验设计
- 生物信息学工具应用:验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为特征提取中的准确性与可靠性