秀丽隐杆线虫高内涵筛选抗感染候选物数据集-2009-kmader
数据来源:互联网公开数据
标签:秀丽隐杆线虫,C.elegans,抗感染,高内涵筛选,细菌感染,抗生素,图像分析,实验数据
数据概述:
本数据集包含使用秀丽隐杆线虫(C.elegans)筛选新型抗感染化合物时获取的图像数据。实验中,线虫被暴露于致病菌粪肠球菌(Enterococcus faecalis),并分为两组,一组未接受治疗(负控组),另一组使用已知对粪肠球菌有效的抗生素阿莫西林(Ampicillin)进行治疗(正控组)。未治疗的线虫主要表现出“死亡”表型,呈现杆状且质地不均匀;接受治疗的线虫主要表现出“存活”表型,呈现弯曲且光滑的形态。
数据集包含了384张图像,分为12列正控(阿莫西林处理组)和12列负控(未处理组)。每张图像为单通道图像,包括亮场(Channel 1)和绿色荧光蛋白(GFP, Channel 2)两个通道。图像尺寸为696 x 520像素,存储格式为16位TIF。
图像文件命名格式为:____.tif
此外,数据集还提供了人工校正的前景/背景分割二值图像,以解决线虫重叠或聚集时的分割问题,每一worm都有一张对应的二值分割图像。
数据来源于Broad Institute,并可在其官方网站下载原始数据:https://data.broadinstitute.org/bbbc/BBBC010/
数据用途概述:
该数据集适用于高内涵筛选技术的研究、抗感染药物筛选的教育与演示、图像处理与机器学习算法的开发等场景。研究人员可以利用这些图像数据进行抗感染候选物的初步筛选和评估;教育者可以将其用于教学演示,帮助学生理解高内涵筛选技术及其在药物发现中的应用;算法开发者可以利用这些图像数据进行图像分割与分类算法的研究。