数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫N2品系(英国布里斯托)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了2009年7月7日在Schafer实验室开展的成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为实验,包含视频追踪数据及特征提取结果,用于线虫行为模式分析。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:N2 on food_2009_07_07__13_27__1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始追踪数据,涉及时间序列、像素坐标等基础观测信息
- 特征数据文件
- 文件名称:N2 on food_2009_07_07__13_27__1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含6579个分割骨架的特征参数
- 压缩数据文件
- 文件名称:N2 on food_2009_07_07__13_27__1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,包含实验相关的结构化数据
数据来源
C.elegans behavioural database(线虫行为数据库)
适用场景
- 线虫行为模式研究: 分析N2品系成年线虫在特定培养基和食物条件下的运动轨迹、行为节律等模式
- 生物实验方法验证: 基于E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 行为特征提取算法测试: 利用tierpsy软件提取的特征数据,评估行为分析算法的准确性
- 模式生物行为数据库补充: 作为线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析