数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了PS4330品系(携带spe-41(sy693)III和him-5(e1490)V基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年7月6日开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,记录时长约九百秒,包含行为特征数据、运动轨迹数据等文件,可用于线虫基因突变体的行为表型分析。
文件详解
- spe-41 (sy693); hin-5 (e1490) on food L_2010_07_06__14_44_0669_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征(如骨架分段数、运动轨迹参数等)
- spe-41 (sy693); hin-5 (e1490) on food L_2010_07_06__14_44_0669.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储线虫运动轨迹的标准化数据,可能包含时间序列的位置、姿态等运动信息
- spe-41 (sy693); hin-5 (e1490) on food L_2010_07_06__14_44_0669.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始或处理后的核心数据,可能包含视频帧对应的行为数据、实验参数记录等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变体行为表型分析: 研究spe-41和him-5基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 线虫行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等提出的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 行为特征提取算法评估: 利用数据集评估tierpsy软件提取线虫行为特征的准确性和有效性
- 遗传学与行为学关联研究: 探索特定基因突变与线虫运动模式、环境适应行为之间的关联机制