数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1818品系(基因型C18B2.6(ok2353)X)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年3月25日开展,包含视频采集及处理后的行为特征数据,涉及线虫在NGM培养基上的运动轨迹、骨架特征等信息,共包含3个数据文件。
文件详解
- 文件名称:C1B2.6 (ok2353) on food R_2010_03_25__11_34_4984.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的核心数据,可能涉及原始轨迹、时间序列等基础观测信息(具体字段未详细说明)
- 文件名称:C1B2.6 (ok2353) on food R_2010_03_25__11_34_4984.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(WCON格式压缩包)
- 字段映射介绍:WCON格式是线虫行为数据交换标准,可能包含标准化的运动轨迹、行为事件等结构化数据
- 文件名称:C1B2.6 (ok2353) on food R_2010_03_25__11_34_4984_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如19468个分割骨架数据、运动参数等(具体字段未详细说明)
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析del-4基因(C18B2.6)突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 线虫行为学机制分析:基于运动轨迹、骨架特征数据,探究线虫觅食、运动模式的生物学机制
- 实验方法验证:验证E. Yemini等提出的线虫行为实验方法在实际场景中的应用效果
- 生物图像分析算法优化:利用标注的行为数据,优化线虫行为追踪与特征提取算法(如tierpsy软件)