数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB648品系(snf-8(ok349)IV基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年11月18日开展,包含线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征,通过视频追踪获取运动参数,可用于研究snf-8基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:snf-8 (ok349)IV on food R_2009_11_18__12_31_0417_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析结果,记录运动轨迹、身体姿态等行为参数
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:snf-8 (ok349)IV on food R_2009_11_18__12_31_0417.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含wcon格式的线虫行为数据文件,记录标准化的行为观测结果
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:snf-8 (ok349)IV on food R_2009_11_18__12_31_0417.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频追踪原始数据,如帧速率(25.3165帧/秒)、像素分辨率(4.67178微米/像素)、分段骨骼数量(19358个)等基础参数
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析snf-8(ok349)IV基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为遗传学实验验证: 验证snf-8基因在调控线虫觅食、运动等行为中的作用机制
- 线虫行为表型分析: 基于视频追踪数据研究线虫的运动轨迹、身体弯曲频率等表型特征
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的基因突变体行为数据支持