数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1052 trpa-1(ok999)突变株成虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据。包含实验条件、视频参数、行为特征提取结果等信息,共涉及3个文件,用于线虫基因功能与行为关联的研究。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:
trpa-1 (ok999) on food R_2010_04_22__15_00_39___7___12.hdf5、trpa-1 (ok999) on food R_2010_04_22__15_00_39___7___12_features.hdf5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始记录与特征提取数据,涉及19476个分段骨架数据、帧率(每秒25.7069帧)、视频像素分辨率(每像素4.31067微米)等参数
- 行为数据压缩文件(.zip格式,1个)
- 文件名称:
trpa-1 (ok999) on food R_2010_04_22__15_00_39___7___12.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的标准化格式数据,总实验时长约899.212秒
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析trpa-1基因对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的调控作用
- 模式生物行为学分析: 基于骨架数据与特征参数,探究突变株与野生型线虫的行为差异
- 神经生物学机制研究: 关联trpa-1通道蛋白功能与线虫感官行为的分子机制
- 实验方法验证: 参考Yemini等人的实验方案,优化线虫行为学实验的标准化流程
- 行为分析工具开发: 基于tierpsy软件提取的特征数据,测试或改进线虫行为分析算法