数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了LX950菌株(携带ocr-4(vs137)IV突变)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据。实验于2010年4月21日开展,包含视频记录及行为特征分析结果,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:ocr-4 (vs137) on food R_2010_04_21__15_18_09211.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的原始监测数据,具体字段基于tierpsy软件采集的线虫行为原始信息
- 特征数据文件
- 文件名称:ocr-4 (vs137) on food R_2010_04_21__15_18_09211_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,如运动轨迹、姿态参数等
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ocr-4 (vs137) on food R_2010_04_21__15_18_09211.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,格式遵循wcon标准(线虫行为数据交换格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变功能研究:分析ocr-4(vs137)IV突变对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的影响
- 神经生物学机制探索:结合行为数据探究ocr-4基因在调控线虫感知与行为反应中的作用
- 模式生物行为分析:作为标准化实验数据,支持秀丽隐杆线虫行为表型的定量分析与比较
- 行为监测技术验证:基于tierpsy软件提取的特征数据,评估线虫行为自动化分析工具的性能
- 基因-行为关联研究:关联ocr-4基因信息与行为特征,构建基因功能与表型的关联模型